MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB8

Total Repeats: 1635

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009933	GCC	2	6	137	142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158341504
2	NC_009933	TG	3	6	180	185	0 %	50 %	50 %	0 %	158341504
3	NC_009933	TGC	2	6	206	211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341504
4	NC_009933	ATC	2	6	499	504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341504
5	NC_009933	AGG	2	6	507	512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158341504
6	NC_009933	GCC	2	6	626	631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158341504
7	NC_009933	ACG	2	6	656	661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341504
8	NC_009933	TG	3	6	665	670	0 %	50 %	50 %	0 %	158341504
9	NC_009933	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158341504
10	NC_009933	GAA	2	6	753	758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158341504
11	NC_009933	ATCT	2	8	775	782	25 %	50 %	0 %	25 %	158341504
12	NC_009933	CAG	2	6	856	861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341504
13	NC_009933	GCA	2	6	959	964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341504
14	NC_009933	GTC	2	6	1013	1018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341504
15	NC_009933	GGT	2	6	1074	1079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158341504
16	NC_009933	GGCAAA	2	12	1105	1116	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	158341504
17	NC_009933	ATC	2	6	1282	1287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341504
18	NC_009933	TGC	2	6	1305	1310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341504
19	NC_009933	CAG	3	9	1348	1356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341504
20	NC_009933	A	6	6	1390	1395	100 %	0 %	0 %	0 %	158341504
21	NC_009933	GCC	2	6	1404	1409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158341504
22	NC_009933	AAC	2	6	1442	1447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158341504
23	NC_009933	CTC	2	6	1471	1476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158341504
24	NC_009933	CCT	2	6	1478	1483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158341504
25	NC_009933	A	6	6	1528	1533	100 %	0 %	0 %	0 %	158341504
26	NC_009933	GTTG	2	8	1782	1789	0 %	50 %	50 %	0 %	158341505
27	NC_009933	GC	3	6	1792	1797	0 %	0 %	50 %	50 %	158341505
28	NC_009933	A	6	6	1967	1972	100 %	0 %	0 %	0 %	158341505
29	NC_009933	AATT	2	8	2052	2059	50 %	50 %	0 %	0 %	158341505
30	NC_009933	TTG	2	6	2084	2089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158341505
31	NC_009933	GAT	2	6	2140	2145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341505
32	NC_009933	TCA	2	6	2173	2178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341505
33	NC_009933	AAT	2	6	2277	2282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158341505
34	NC_009933	TCCA	2	8	2509	2516	25 %	25 %	0 %	50 %	158341506
35	NC_009933	ATT	2	6	2517	2522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158341506
36	NC_009933	TC	3	6	2645	2650	0 %	50 %	0 %	50 %	158341506
37	NC_009933	GTT	2	6	2705	2710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158341506
38	NC_009933	AG	3	6	2787	2792	50 %	0 %	50 %	0 %	158341506
39	NC_009933	TCG	2	6	2796	2801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341506
40	NC_009933	CTG	2	6	3003	3008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341506
41	NC_009933	AT	3	6	3032	3037	50 %	50 %	0 %	0 %	158341506
42	NC_009933	CGT	2	6	3048	3053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341506
43	NC_009933	GA	3	6	3096	3101	50 %	0 %	50 %	0 %	158341506
44	NC_009933	CATC	2	8	3107	3114	25 %	25 %	0 %	50 %	158341506
45	NC_009933	GTT	2	6	3316	3321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158341506
46	NC_009933	AAT	2	6	3391	3396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158341506
47	NC_009933	TGA	2	6	3460	3465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341506
48	NC_009933	GTT	2	6	3469	3474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158341506
49	NC_009933	TGA	2	6	3497	3502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341506
50	NC_009933	CT	3	6	3512	3517	0 %	50 %	0 %	50 %	158341506
51	NC_009933	TCA	2	6	4384	4389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341507
52	NC_009933	ATAG	2	8	4397	4404	50 %	25 %	25 %	0 %	158341507
53	NC_009933	CAG	2	6	4424	4429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341507
54	NC_009933	TTCTG	2	10	4440	4449	0 %	60 %	20 %	20 %	158341507
55	NC_009933	GCC	2	6	4455	4460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158341507
56	NC_009933	CAT	2	6	4495	4500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341507
57	NC_009933	GGC	2	6	4658	4663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158341507
58	NC_009933	CAT	2	6	4696	4701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341507
59	NC_009933	GAC	2	6	4745	4750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341507
60	NC_009933	ACG	2	6	4790	4795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341507
61	NC_009933	CT	3	6	4889	4894	0 %	50 %	0 %	50 %	158341507
62	NC_009933	CTGA	2	8	4973	4980	25 %	25 %	25 %	25 %	158341507
63	NC_009933	CTC	2	6	5066	5071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158341507
64	NC_009933	CTG	2	6	5144	5149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341507
65	NC_009933	CTT	2	6	5179	5184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158341507
66	NC_009933	AG	3	6	5258	5263	50 %	0 %	50 %	0 %	158341507
67	NC_009933	C	6	6	5273	5278	0 %	0 %	0 %	100 %	158341507
68	NC_009933	ATCC	2	8	5286	5293	25 %	25 %	0 %	50 %	158341507
69	NC_009933	ATC	2	6	5330	5335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341507
70	NC_009933	CTT	2	6	5395	5400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158341507
71	NC_009933	TCT	2	6	5685	5690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158341507
72	NC_009933	AT	3	6	5710	5715	50 %	50 %	0 %	0 %	158341507
73	NC_009933	AGA	2	6	5762	5767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158341507
74	NC_009933	TTG	2	6	5892	5897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158341507
75	NC_009933	CTT	2	6	5962	5967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158341507
76	NC_009933	TTC	2	6	6015	6020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158341507
77	NC_009933	GGTGC	2	10	6158	6167	0 %	20 %	60 %	20 %	158341507
78	NC_009933	GGA	2	6	6175	6180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158341507
79	NC_009933	TCT	2	6	6217	6222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158341507
80	NC_009933	TG	3	6	6252	6257	0 %	50 %	50 %	0 %	158341507
81	NC_009933	CTT	2	6	6283	6288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158341507
82	NC_009933	TC	4	8	6324	6331	0 %	50 %	0 %	50 %	158341507
83	NC_009933	TCG	2	6	6365	6370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341507
84	NC_009933	AG	3	6	6464	6469	50 %	0 %	50 %	0 %	158341507
85	NC_009933	CTG	2	6	6527	6532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341507
86	NC_009933	TGA	2	6	6535	6540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341507
87	NC_009933	GCG	2	6	6600	6605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158341507
88	NC_009933	GCT	2	6	6660	6665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341507
89	NC_009933	CCA	2	6	6697	6702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158341507
90	NC_009933	GGTTC	2	10	6730	6739	0 %	40 %	40 %	20 %	158341507
91	NC_009933	GGGT	2	8	6742	6749	0 %	25 %	75 %	0 %	158341507
92	NC_009933	TGA	2	6	6841	6846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341507
93	NC_009933	GCT	2	6	6862	6867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341507
94	NC_009933	CT	3	6	6866	6871	0 %	50 %	0 %	50 %	158341507
95	NC_009933	AGT	2	6	6887	6892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341507
96	NC_009933	TGAGC	2	10	6938	6947	20 %	20 %	40 %	20 %	158341507
97	NC_009933	G	6	6	7015	7020	0 %	0 %	100 %	0 %	158341507
98	NC_009933	ATG	2	6	7053	7058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341507
99	NC_009933	GTG	2	6	7086	7091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158341507
100	NC_009933	TCA	2	6	7155	7160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341507
101	NC_009933	GA	3	6	7227	7232	50 %	0 %	50 %	0 %	158341507
102	NC_009933	GCA	2	6	7242	7247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341507
103	NC_009933	G	6	6	7279	7284	0 %	0 %	100 %	0 %	158341507
104	NC_009933	ACT	2	6	7323	7328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341507
105	NC_009933	TGG	2	6	7584	7589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158341507
106	NC_009933	ATG	3	9	7721	7729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341507
107	NC_009933	GCA	2	6	7740	7745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341507
108	NC_009933	GAT	2	6	7814	7819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341507
109	NC_009933	TGC	2	6	8050	8055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341507
110	NC_009933	CTT	2	6	8086	8091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158341507
111	NC_009933	GTA	2	6	8102	8107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341507
112	NC_009933	CT	3	6	8109	8114	0 %	50 %	0 %	50 %	158341507
113	NC_009933	GTA	2	6	8123	8128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341507
114	NC_009933	TGG	2	6	8158	8163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158341507
115	NC_009933	CTTT	2	8	8343	8350	0 %	75 %	0 %	25 %	158341508
116	NC_009933	GAG	2	6	8388	8393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158341508
117	NC_009933	CAG	2	6	8417	8422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341508
118	NC_009933	AGCAA	2	10	8709	8718	60 %	0 %	20 %	20 %	158341508
119	NC_009933	AACT	2	8	8786	8793	50 %	25 %	0 %	25 %	158341508
120	NC_009933	CAA	2	6	8934	8939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158341508
121	NC_009933	TC	3	6	8983	8988	0 %	50 %	0 %	50 %	158341508
122	NC_009933	AGA	2	6	9047	9052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158341508
123	NC_009933	ATC	2	6	9116	9121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341508
124	NC_009933	AGAA	2	8	9124	9131	75 %	0 %	25 %	0 %	158341508
125	NC_009933	ACAGCT	2	12	9143	9154	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158341508
126	NC_009933	CAA	3	9	9226	9234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158341508
127	NC_009933	CAG	2	6	9486	9491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341508
128	NC_009933	CTA	2	6	9504	9509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341508
129	NC_009933	AATC	2	8	9996	10003	50 %	25 %	0 %	25 %	158341509
130	NC_009933	TAC	2	6	10049	10054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341509
131	NC_009933	CTT	2	6	10072	10077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158341509
132	NC_009933	CAA	2	6	10121	10126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158341509
133	NC_009933	GGGC	2	8	10173	10180	0 %	0 %	75 %	25 %	158341509
134	NC_009933	GAA	2	6	10214	10219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158341509
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145	NC_009933	CGG	2	6	10883	10888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158341509
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255	NC_009933	GA	3	6	19630	19635	50 %	0 %	50 %	0 %	158341524
256	NC_009933	CCT	2	6	19641	19646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158341524
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258	NC_009933	CCT	2	6	19767	19772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158341524
259	NC_009933	GA	3	6	19882	19887	50 %	0 %	50 %	0 %	158341524
260	NC_009933	CCT	2	6	19893	19898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158341524
261	NC_009933	TAG	2	6	19944	19949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341524
262	NC_009933	TCA	3	9	20081	20089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341524
263	NC_009933	TGA	2	6	20112	20117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341524
264	NC_009933	TGC	2	6	20136	20141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341524
265	NC_009933	ACCA	2	8	20197	20204	50 %	0 %	0 %	50 %	158341524
266	NC_009933	TTGCA	2	10	20205	20214	20 %	40 %	20 %	20 %	158341524
267	NC_009933	TGA	2	6	20288	20293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341524
268	NC_009933	AACA	2	8	20441	20448	75 %	0 %	0 %	25 %	158341524
269	NC_009933	TTCT	2	8	20455	20462	0 %	75 %	0 %	25 %	158341524
270	NC_009933	CAACT	2	10	20483	20492	40 %	20 %	0 %	40 %	158341524
271	NC_009933	TGC	2	6	20497	20502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341524
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273	NC_009933	CT	3	6	20535	20540	0 %	50 %	0 %	50 %	158341524
274	NC_009933	ACCC	2	8	20659	20666	25 %	0 %	0 %	75 %	158341524
275	NC_009933	CA	3	6	20670	20675	50 %	0 %	0 %	50 %	158341524
276	NC_009933	TTGAAT	2	12	20695	20706	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158341524
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278	NC_009933	TCC	2	6	20762	20767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158341524
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280	NC_009933	GACC	2	8	20786	20793	25 %	0 %	25 %	50 %	158341524
281	NC_009933	GTG	2	6	20807	20812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158341524
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284	NC_009933	CAA	2	6	20883	20888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158341524
285	NC_009933	ATC	2	6	20953	20958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341524
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289	NC_009933	TAC	2	6	21322	21327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341525
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292	NC_009933	TGT	2	6	21387	21392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158341525
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299	NC_009933	GATG	2	8	24729	24736	25 %	25 %	50 %	0 %	158341528
300	NC_009933	CGA	2	6	24802	24807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341528
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380	NC_009933	AG	3	6	29873	29878	50 %	0 %	50 %	0 %	158341538
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384	NC_009933	CTC	2	6	30177	30182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158341539
385	NC_009933	TCA	2	6	30214	30219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341539
386	NC_009933	ACG	2	6	30268	30273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341539
387	NC_009933	TGC	3	9	30400	30408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341539
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389	NC_009933	ATC	2	6	30515	30520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341540
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492	NC_009933	TC	3	6	37807	37812	0 %	50 %	0 %	50 %	158341553
493	NC_009933	ATTT	2	8	37867	37874	25 %	75 %	0 %	0 %	158341553
494	NC_009933	ATT	2	6	37948	37953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158341553
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499	NC_009933	ACA	2	6	38170	38175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158341553
500	NC_009933	CTTAC	2	10	38187	38196	20 %	40 %	0 %	40 %	158341553

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